TCDD Teftiş Kurulu Başkanlığı’nın olaya ilişkin hazırladığı soruşturma raporuna göre, Babacan, Ulusal Demiryolu Sinyalizasyon Projesi çerçevesinde 1. ve 3. Bölge Müdürlüğü mıntıkalarındaki açık ihale ve doğrudan teminle gerçekleştirilen 32 sinyalizasyon projesinin ihale, temin ve tatbikatında görevlendirildi.

Raycan şirketinin 2011-2013 yıllarında 1. Bölge Müdürlüğü'nden dört açık ihalede 593 bin 900 TL'lik, 17 adet doğrudan teminle 574 bin 614 TL'lik, 2012-2013'te 3. Bölge Müdürlüğü'nde 11 adet doğrudan teminle 415 bin 550 TL'lik iş aldığı belirlendi.

Soruşturma raporunda, Babacan'ın bu projelere yönelik belgeleri hazırladığı ve yüklenici firmaları iş ve imalatı ya eksik yaptığı veya hiç yapmadığı halde "Uygundur" şeklinde tutanak tuttuğu aktarıldı. Bu yolla Babacan'ın yüklenici firmalara usulsüz ödeme yapıldığı belirtildi.

Babacan, sinyalizasyon projelerine ait dört açık ihalenin üçünde görevlendirilmesine, ihale komisyonuna üye sıfatıyla katılmasına rağmen eşi Sündüs Babacan'ın ortağı olduğu Raycan firmasının ihalelere katılmasına göz yumdu. Ayrıca 28 adet doğrudan temin işini eşinin firmasına verdi.

Yürütülen soruşturma sonunda Anadolu Cumhuriyet Başsavcılığı, Babacan ve eşinin de aralarında olduğu 31 sanık hakkında kamu kurum ve kuruluşlarının ihalesine fesat karıştırmak suçundan üç yıldan yedi yıla kadar hapis cezası istemiyle iddianame düzenledi. İddianame İstanbul 8. Asliye Ceza Mahkemesi'ne gönderildi. Ancak mahkeme 31 Ekim'de görevsizlik kararı vererek, dosyayı ağır ceza mahkemesine gönderdi. Kararda, bu eylemlerin zimmet suçuna girebileceği kaydedildi.